Vaksinasi adalah pemberian Vaksin dalam rangka  meningkatkan kekebalan seseorang secara aktif terhadap suatu penyakit, sehingga apabila suatu saat terpapar dengan penyakit tersebut tidak akan sakit atau hanya mengalami sakit ringan dan tidak menjadi sumber penularan.

Klinik Amalia Bunda Medika memiliki tenaga vaksinator yang sudah tersertifikasi yang terdiri dari dokter dan perawat. Vaksinator memberikan pelayanan vaksinasi setiap hari di poli vaksin dan memberikan pelayanan di luar seperti di kementerian- kementerian yang ditunjuk oleh Kementerian Kesehatan.

Saat ini Klinik Amalia Bunda Medika saat ini telah memiliki layanan vaksinasi terutama vaksin haji umroh, Bagi Pelaku Perjalanan Luar Negeri (PPLN) dan Pekerja Migran Indonesia (PMI) serta vaksinasi internasional yang sudah tersertifikasi ICV (International Certificate of Vaccination). Sertifikat vaksin internasional memiliki banyak manfaat. Sertifikat vaksin internasional bisa dijadikan bukti bahwa seseorang telah menerima vaksinasi primer lengkap.